AlphaMissense 실데이터 연결됨 AlphaGenome API 연결됨 Gemini 연결됨
연동 안내 — 점수를 임의 생성하지 않습니다. 환경변수 ALPHAMISSENSE_DATA(TSV 경로) / ALPHAGENOME_API_KEY를 설정하면 실제 예측값이 자동 표시됩니다. 두 모델은 비상업 연구용 라이선스입니다.

AlphaMissense란

Overview
AlphaFold를 변이 빈도 데이터로 미세조정해 단백질 코딩 미스센스 변이(전체 게놈의 약 2%)의 병원성을 예측하는 모델입니다(Cheng et al., Science 2023). 변이를 양성 가능 / 불확실 / 병원성 가능으로 분류하며, ClinVar와 높은 일치를 보입니다. 최근에는 산전 진단(예: 초음파 이상 태아의 L1CAM 변이 병원성 신속 판정)에도 활용됩니다.
비코딩(98%) 조절 변이는 AlphaGenome(별도 아이템)이 담당합니다.

적재 현황 (실데이터)

Loaded
적재 변이
4,677,806
missense variants
유전자
314
genes
병원성
2,174,257
불확실
648,826
양성
1,854,723

변이 병원성 검색

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35개 유전자 미스센스 변이 (4,677,806개) 즉시 조회

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TPMT — 4,655개 변이 (점수 높은 순, 52/94p)
변이병원성 확률분류3D
E114M 0.3505 불확실
Y131C 0.3504 불확실
F223C 0.3503 불확실
G62W 0.3502 불확실
T169E 0.3500 불확실
K50H 0.3498 불확실
E225M 0.3497 불확실
H52F 0.3497 불확실
L48H 0.3495 불확실
E203A 0.3495 불확실
L57Q 0.3490 불확실
D137T 0.3489 불확실
G62I 0.3489 불확실
Q22C 0.3484 불확실
F236Q 0.3483 불확실
V156A 0.3480 불확실
E110H 0.3475 불확실
G62Y 0.3473 불확실
V184F 0.3472 불확실
V220H 0.3471 불확실
Q179P 0.3470 불확실
F146V 0.3468 불확실
L241K 0.3468 불확실
C183T 0.3463 불확실
D168L 0.3457 불확실
E114P 0.3455 불확실
L49V 0.3454 불확실
P200R 0.3454 불확실
G45C 0.3451 불확실
Y107W 0.3451 불확실
V120T 0.3448 불확실
Y13M 0.3448 불확실
R226A 0.3445 불확실
Q30N 0.3442 불확실
S172H 0.3440 불확실
R226V 0.3436 불확실
G95S 0.3436 불확실
P200G 0.3432 불확실
L48Y 0.3427 불확실
D162G 0.3425 불확실
S172V 0.3423 불확실
P200H 0.3423 불확실
L53K 0.3423 불확실
F236M 0.3418 불확실
F146I 0.3417 불확실
K219G 0.3416 불확실
D188Y 0.3413 불확실
R82N 0.3407 불확실
D162V 0.3403 불확실
K177Y 0.3402 불확실

드라이버 변이 병원성

Variants
유전자변이 AlphaMissense병원성 확률 출처TCGA 빈도3D 구조
BRAF V600E 병원성 가능 0.993 AlphaMissense 실데이터 SKCM 53% 보기
KRAS G12D 병원성 가능 0.998 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
KRAS G12C 병원성 가능 0.998 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
KRAS G12V 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
NRAS Q61K 병원성 가능 0.985 AlphaMissense 실데이터 SKCM 29% 보기
HRAS G12V 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 - 보기
TP53 R175H 병원성 가능 0.986 AlphaMissense 실데이터 PAAD 61% 보기
TP53 R248Q 병원성 가능 0.996 AlphaMissense 실데이터 PAAD 61% 보기
EGFR L858R 병원성 가능 0.997 AlphaMissense 실데이터 GBM 24% 보기
PIK3CA H1047R 불확실 0.538 AlphaMissense 실데이터 BRCA 34% 보기
IDH1 R132H 병원성 가능 0.992 AlphaMissense 실데이터 GBM 6% 보기
IDH2 R172K 병원성 가능 0.994 AlphaMissense 실데이터 - 보기
KIT D816V 병원성 가능 0.999 AlphaMissense 실데이터 - 보기
CTNNB1 S37F 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 - 보기

병원성 확률(0~1)은 실데이터 연동 시에만 표시됩니다. 현재 분류는 임상적으로 확립된 드라이버 기준(예시)이며 AlphaMissense도 동일하게 병원성으로 분류합니다.

산전 진단 연계

Prenatal
AlphaMissense는 초음파 이상 태아에서 발견된 미스센스 변이(예: L1CAM)의 병원성을 신속 판정해 산전 진단 워크플로를 가속한 사례가 보고되었습니다. 양수·융모막 확진검사 · 게놈 산전 종합 리포트와 연계됩니다.

실데이터 연동 방법

Setup
1. AlphaMissense 점수(비상업 연구용)를 받아 우리 유전자 서브셋 TSV로 변환:
gene  protein_variant  am_pathogenicity  am_class (탭 구분)
2. 환경변수 지정: ALPHAMISSENSE_DATA=/path/to/alphamissense_subset.tsv
3. 새로고침하면 위 표의 병원성 확률이 실제 값으로 자동 대체되고 출처가 "AlphaMissense 실데이터"로 표시됩니다.